江苏省产业技术研究院膜科学技术研究所:

依托南京工业大学国家特种分离膜工程技术研究中心建设。以国家战略性新兴产业高性能膜材料为研究领域，重点研究解决膜产业及相关行业发展中急需的关键技术、核心技术和共性技术，推动膜技术在水处理、钢铁、石化、环保等领域的应用。

江苏省产业技术研究院工业生物技术研究所:

依托南京工业大学国家生化工程技术研究中心建设，以先进生物与化学制造替代传统化学制造、生物质资源替代化石资源核心技术为研发重点，服务领域涉及化工、医药、能源、材料、食品、环境等。